Unity3D引擎处理纹理：不论你导入的是PNG，PSD还是TGA，它们都会被自动转换成Unity自己的Texture2D格式。（美术资源规范：贴图长宽应为4的倍数）
不同平台的图集格式选择方案(TextureImporterFormat)：
Android：
RGB Compressed ETC1 4 bits+Alpha(方形)
iOS：
RGB Compressed PVRTC 4 bits+Alpha(方形)
所以图集需要设置为方形。
对于非方形的纹理：
Android：
低画质：RGB Compressed ETC2 4 bits(非透明)/RGBA Compressed ETC2 8 bits(透明)
中画质：RGBA 16 bits
高画质： RGBA 32 bits
ETC2 的格式理论上只在OpenGL ES 3.0 的设备上被支持，而在不被支持的设备上则会内部自动转成 RGBA32/ARGB32的格式，这对于 RGBA Compressed ETC2 8bits 的纹理就是放大了 4 倍。
iOS：
低画质：RGBA 16 bits
高画质： RGBA 32 bits
纹理资源方面的问题除了尺寸外，纹理格式、Mipmap设置和Read&Write功能
格式修改代码：
TextureImporter import = AssetImporter.GetAtPath(path) as TextureImporter;
AssetDatabase.ImportAsset(path);
分离Alpha通道及合并图集两张贴图的Shader可以参考 链接